1996. gada 26. martā Ministru kabinets Preiļu 1. vidusskolai piešķir Valsts ģimnāzijas statusu. Preiļu Valsts ģimnāzija oficiāli darbu uzsāk 1996. gada 2. septembrī.
No 1996. gada līdz 2003. gada 25. jūnijam skolas direktors ir Jānis Eglītis. Sakarā ar Jāņa Eglīša ievēlēšanu par Preiļu novada domes priekšsēdētāju saskaņā ar 2003. gada 25. jūnija novada domes sēdes lēmumu par Preiļu Valsts ģimnāzijas direktora vietas izpildītāju no 2003. gada 01. jūlija strādāja Ligita Pauniņa. 2016. gada 06. oktobrī skolai mainīts nosaukums uz Jāņa Eglīša Preiļu Valsts ģimnāzija.
Kopš 2005. gada 11. maija IZM saskaņojumu un 2005. gada 17. maija Preiļu novada domes lēmumu Preiļu Valsts ģimnāzijas direktore ir Ligita Pauniņa.
2020. gada rudenī JEPVĢ tika akreditēta līdz 2026. gada 1. decembrim.
Izglītības programmas akreditētas līdz 2026. gada 1. decembrim.
2022./2023. m.g. ģimnāzijā mācās 166 audzēkņi un strādā 26 skolotāji.
JĀŅA EGLĪŠA PREIĻU VALSTS ĢIMNĀZIJAS VĒRTĪBAS:
CIEŅA
ATBILDĪBA
IZAUGSME
Mūsu lepnums ir mūsu skolēni.
Mūsu spēks ir mūsu skolotāji.
Preiļu Valsts ģimnāzija gadalaikos
Atceries dzidros rudens rītus, kad jau salna apzieda pļavas ar sniegu. Debesis tad austrumos bij dzeltenas kā vasks, un rietumos kvēloja plata varavīksne. Rubeņiem sajuka visi jēdzieni par gada laikiem, un tie sāka rubināt kā pavasarī. /J.Jaunsudrabiņš/
Atceries tad Latviju ziemas baltajā mierā. Kupenas tur sniedzās pāri visaugstākajiem žogiem, dažkārt savienodamās ar zemāku ēku jumtiem. Pārsala upes un ezeri tā, ka varēja iet un braukt, kur padomājis, ar vissmagākiem vezumiem. /J.Jaunsudrabiņš/
Atceries tikai! Kur tu citur atradīsi tādu pavasari, kur tik rožainā gaismā kvēlo bērzi, veselas jauno bērzu birzis, kamēr tie vēl pumpuroti, un nekur tie tā nesmaržo, kad saplaukst! /J.Jaunsudrabiņš/
“… piemini Latvijas vasaru!
Viņa sākās ar liepu ziedēšanu un meža zemeņu sārtumu, un izskanēja ar viršu mēļumu.
Ar bišu dziesmu tā nāca un aizgāja, pati silta un zeltaina, kā medus piesūkusies.”
Mājaslapu veidoja: Eduards Lipiniks (Absolvents 3.D), palīdzēja Daniels Freimanis (Absolvents 3.V)